《扑通扑通的水球少年》讲述了临近毕业的周致远被妹妹的水球教练凌颢儿的飒爽英姿所触动，决心重组校园水球队的故事。他先是说服了曾经的"老油条"三人组回归，又吸纳了被篮球队淘汰却爆发力惊人的陈玉亭、水性极佳的江嘉，以及因伤退役的前省级天才选手白浪，一支看似散漫却暗藏潜力的队伍就此成型。 　　这支临时拼凑的队伍面临着内外交困的窘境：对外要与游泳队争夺训练场地，对内则要应对队员随时可能放弃的消极心态。训练过程中，这群性格迥异的少年闹出不少笑话——有人把水球当篮球扣，有人因怕水抱着浮板不放，更有队员为逃避训练假装抽筋。但在嬉闹背后，每个人都逐渐找到了坚持的理由，团队开始有了破浪前行的凝聚力。 　　转机出现在白浪邀请暗恋多年的师姐凌颢儿担任教练后。这位严厉又温柔的教练不仅用专业训练让队伍脱胎换骨，更在与白浪的朝夕相处中暗生情愫。当两人在夕阳下的泳池边指尖相触时，白浪曾经的劲敌刘锋突然出现，以省队选拔赛为由向这支新生队伍发起挑战，将故事推向高潮。