《绝世神皇》讲述了一位少年从卑微崛起，最终登临武道巅峰的热血传奇。主角秦问天原本是青玄城秦家的废物少主，因无法觉醒命魂而受尽欺凌。然而他体内却隐藏着神秘的太古神脉，在机缘巧合下获得上古神皇传承，从此踏上逆天改命之路。 　　随着修为突破，秦问天发现自己的身世与万年前陨落的神皇有着千丝万缕的联系。为解开谜团，他走出青玄城，在九霄大陆闯荡历练，收服神兽、领悟法则，以无敌之姿横扫各路天骄。期间他结识了圣女洛神曦、剑痴叶孤影等挚友，也遭遇了黑暗神殿等势力的追杀，在生死磨砺中不断突破极限。 　　当域外魔族入侵大陆时，秦问天觉醒神皇记忆，率领人族强者展开史诗决战。最终他以牺牲神脉为代价，施展禁忌神通封印魔渊，成为守护苍生的新代神皇。故事在主角建立不朽神朝、打破虚空寻找更高武道境界的开放式结局中收尾，留下无尽遐想。