《新施公案》以清康熙年间为背景，讲述了名将施琅之子施仕伦（范明饰）出任泰州知府的传奇故事。施仕伦为官清廉，深受百姓爱戴，被尊称为“施公”。康熙皇帝（李子雄饰）南巡途经泰州时，亲眼目睹施公审理臧保一案的过程，对其人性化的办案方式赞叹不已，亲赐他“江南第一清官”的称号，并将其调任扬州，委以重任。 　　在扬州上任后，施公得到师爷白杨（赵锦焘饰）和发妻表妹柳青衣（郭珍霓饰）的鼎力相助，二人成为他办案的左膀右臂。此外，下属杜康（王桀饰）和捕快丁忠（杨珑饰）等人也全力配合施公秉公执法，破获了诸多疑案陈案，维护了地方安宁。然而，平静之下暗流涌动，十三皇子胤祥突然失踪，引发朝野震动，各地官员纷纷猜测宫中或有变故。 　　施公经过缜密调查，发现此事背后隐藏着鳌拜后人南德（马光泽饰）等人的阴谋。在追查真相的过程中，施公不仅成功化解危机，还与胤祥结下深厚情谊。剧情通过一系列悬疑案件，展现了施公的智慧与正义，同时也刻画了康熙年间的官场风云和民间百态。