《我的奇妙男友》讲述了一个充满奇幻色彩的爱情故事。在一个寂静的夜晚，娱乐圈二线女星田净植（吴倩 饰）驾车行驶在荒郊野外时，与一辆迎面而来的货车相撞。诡异的是，货车上竟搭载着一具棺材，而净植的血意外流进棺材，唤醒了沉睡百年的神秘男子薛灵乔（金泰焕 饰）。 　　薛灵乔是一个拥有特殊体质的“基因突变人”，他不会生病也不会受伤，已经活了四百多年。一百年前，他遭人陷害被放干血液，随后被封印在棺材中。净植的血液让他重获新生，苏醒后的薛灵乔救下了昏迷的田净植，并因种种机缘巧合住进了她的家中。 　　突如其来的“同居”让田净植的生活彻底被打乱，她不得不面对这个神秘又霸道的“奇妙男友”。然而，随着两人相处，薛灵乔背后的秘密逐渐浮出水面，一场围绕他的阴谋也悄然逼近。两人在危机中相互扶持，渐渐萌生情愫，展开了一段跨越百年的奇幻爱恋。