《加美拉对深海怪兽吉古拉》讲述了海洋学者之子健一与海伦目睹神秘飞行物体坠海后，与父亲一行四人乘船调查却遭外星人绑架的故事。他们被带入一艘宇宙飞船，自称吉古拉星人的女性为展示科技实力，当场引发东京13级大地震，并胁迫人类投降。吉古拉星人因母星海洋被污染而觊觎地球，企图霸占海洋并将人类作为食物。孩子们侥幸逃脱飞船，但吉古拉星人化身的女性紧随其后登陆。 　　与此同时，加美拉的火焰攻击引爆了宇宙飞船，海中浮现出银色怪兽——这才是吉古拉星人的真身。由于地球水压差异，吉古拉迅速巨大化。加美拉试图将战场引至吉古拉不适应的陆地，却因连续光线攻击坠海失去行动能力。自卫队的武器对吉古拉完全无效，而冒险营救加美拉的健一等人反被拖入万米深的日本海沟。面对人质威胁，自卫队总司令被迫宣布投降。 　　作为昭和加美拉系列实际上的终章，本片与鸭川海洋世界合作，大量场景取景于此。受限于预算，战斗仅限海中与海岸，缺乏城市破坏场面。剧情以海洋污染为主题，呼应同期《哥斯拉对黑多拉》的环保诉求，但相比系列前作逻辑松散，转折生硬——如轻易逃脱飞船、仅凭四人被挟持就让全人类投降等设定，连儿童观众都觉牵强。不过“孩童生命重于地球”恰是加美拉系列的核心特质。 　　饰演吉古拉星人傀儡的八并映子成为亮点，其比基尼装扮狂奔的场面给当时小观众留下深刻印象。影片原非计划中的系列完结篇，因大映公司破产意外终止。此后加美拉沉寂九年才以《宇宙怪兽加美拉》重启，真正回归则要等到24年后的《大怪兽空中决战》。