《爱情理论特别篇》延续了原剧的浪漫基调，以主角Third和Khai的感情发展为线索，讲述了两人从暧昧试探到坚定相守的甜蜜历程。影片开场以Third的独白切入，他站在电影放映厅里凝视着银幕，回忆起与Khai相识以来的点点滴滴——那些误会、争吵、心动的瞬间，以及最终勇敢表白的夜晚。画面随着他的回忆不断闪回，观众得以重温原剧中经典场景，如Third偷偷为Khai剪辑影片、雨夜里的告白、以及两人在星空下第一次牵手。 　　故事主线聚焦于两人正式交往后的生活日常。Third开始尝试突破自己内向的性格，主动参与Khai的朋友聚会；而曾经风流不羁的Khai则变得格外黏人，甚至因为Third与学弟讨论剧本而吃醋。当Third获得海外电影进修机会时，两人面临第一次重大考验。Khai表面支持却暗自焦虑，Third敏锐察觉后，用两人专属的"电影理论"沟通方式——在深夜放映厅播放自制短片，将《爱在黎明破晓前》的经典台词重新剪辑，向Khai传递"短暂分离只为更好相遇"的心意。 　　影片高潮发生在Third出国前夕的送别派对。Khai突然消失，当Third焦急寻找时，所有朋友突然举起写着电影台词的灯牌，Khai则捧着胶片盒造型的戒指盒出现。原来他偷偷联系了Third心仪的导演录制祝福视频，并说出全片最动人的告白："你总说生活不像电影，但遇见你之后，我的每一天都像最完美的蒙太奇。"特别篇最终以两人在机场相拥告别的长镜头作结，画面渐渐淡出为老式胶片放映机的光斑，呼应着全片"爱情如电影般需要用心剪辑"的主题。