《深海巨灵大海龟》讲述了一个充满奇幻与温情的海洋冒险故事。影片以海边长大的孤独小男孩为主角，他常常独自在海边玩耍，直到有一天，一个神秘的小女孩从海中出现，两人迅速成为朋友。他们在沙滩上共同发现了一只小海龟，并在它的背上刻下了一个特殊图案作为纪念。黄昏时分，小女孩将一串项链赠予男孩作为离别礼物，随后消失在海浪中，留给男孩无尽的思念与疑问。 　　十年后，男孩已成长为一名年轻人。某天，科学家们在深海发现了一只体型堪比足球场的史前巨型海龟，引发社会轰动。许多人蜂拥而至，有的为了科学研究，有的则想借此发财。出于好奇，年轻人也加入了探险队伍。这只海龟的庞大令人震撼，连凶猛的鲨鱼在它面前都显得渺小。尽管外形骇人，海龟却对人类毫无敌意，反而显得温和。探险队尝试了各种方法捕捉它，却屡屡失败，最终只剩下一名执着的黑人成员仍未放弃。 　　就在此时，一位神秘女子突然出现在年轻人面前，劝说他放弃捕捉海龟的计划。年轻人惊讶地认出，她正是童年时那个消失在海中的女孩。他满心疑惑，正想追问她的身份和过往，却被黑人的呼唤打断。等他再次回头，女子已如幻影般消失无踪，留下他陷入更深的谜团与抉择——是继续参与这场危险的捕捉行动，还是保护这只与自己命运相连的深海巨灵？