《太空异种1999》讲述了宇航员史宾塞与妻子吉莉安平静的生活被一次太空任务彻底打破的故事。史宾塞和搭档艾力克斯在执行卫星维修任务时遭遇爆炸事故，与地面失联两分钟。尽管两人最终安全返回地球，但他们对此段经历讳莫如深，这种反常的沉默让吉莉安感到不安。 　　随着时间推移，诡异的事件接连发生。史宾塞决定辞去太空总署的工作，计划与妻子搬往纽约开始新生活。然而就在此时，艾力克斯和妻子娜塔莉相继离奇死亡，这进一步加深了吉莉安的恐惧。她开始怀疑丈夫在太空中经历了某种不可告人的变故，而这两分钟的神秘空白或许隐藏着可怕的真相。 　　吉莉安发现史宾塞的行为逐渐变得异常，他时常表现出不符合常理的生理特征和情绪波动。与此同时，他们的周围不断出现难以解释的现象，似乎有某种未知的力量在暗中操控一切。吉莉安意识到，丈夫可能已不再是原来的他，而真正的威胁正一步步逼近他们的生活。 　　随着调查深入，吉莉安逐渐揭开了一个令人毛骨悚然的秘密——史宾塞和艾力克斯在太空中可能被某种外星生命体寄生。这种生物能够完美模仿人类的外表和行为，但内在却充满敌意。为了生存，吉莉安必须面对这个占据丈夫身体的"异种"，并在真相与恐惧之间做出抉择。影片在悬疑与科幻的交织中，探讨了身份、信任与生存的深刻主题。