《古墓荒斋》讲述了一心求取功名的书生杨予畏在荒斋苦读时，与美丽鬼魂连琐相识相恋的故事。杨予畏在荒斋中邂逅连琐，两人日久生情，然而阴界的白无常欲强娶连琐为妾，杨予畏挺身而出，挫败白无常的阴谋，并将连琐带回家中庇护。然而，连琐的父亲连父嫌弃杨予畏身份低微，坚决反对两人的婚事，使得这段人鬼之恋陷入困境。 　　心灰意冷的杨予畏决定进京赶考，途中遭遇不测，幸得狐狸精乔娜一家相救。乔娜一家不仅收留他养伤，还鼓励他继续备考。痊愈后，杨予畏再次启程，却在路上遇到桂花精聂小倩的调戏。面对聂小倩的美色诱惑，杨予畏不为所动，展现出君子之风。聂小倩被他的正直打动，不仅传授他躲避妖魔的秘诀，还施法助他在考场上金榜题名，登上龙虎榜。 　　功成名就的杨予畏在返乡途中，恰逢乔娜一家遭遇雷霆劫难，他义无反顾地出手相救，报答昔日的恩情。然而，当他满怀希望回到连府时，却得知连琐因思念成疾，早已悬梁自尽。痴情的连琐未能等到与杨予畏重逢之日，这段跨越阴阳的凄美爱情最终以悲剧收场。影片通过人鬼妖三界的纠葛，展现了杨予畏的善良、正直与连琐的忠贞不渝，令人唏嘘不已。