《噬神者》的故事发生在五十年后的未来，世界因“荒神”的肆虐而濒临崩溃。这些突如其来的怪物拥有“捕食”本能，能够吞噬一切物质，甚至令人类既有的武器彻底失效。面对文明崩坏的危机，生化科技企业“芬里尔”利用荒神细胞开发出了名为“神机”的生物兵器，并组建了特殊部队“GOD EATER”，人类终于获得了与荒神对抗的力量。 　　荒神是一种追求知性进化的神秘生物，而人类则为了物种的延续奋起反抗。在这场生存之战中，双方都在不断进化，究竟是荒神先获得人性，还是人类在战斗中超越自我成为“神”？答案尚未可知。作为“GOD EATER”的一员，玩家将扮演一名神机使，肩负起保护地下居住区的重任，击退来袭的荒神，并回收它们的核心与素材。 　　每一天都与死亡擦肩而过，神机使们在绝望的边缘挣扎求生。他们不仅要面对荒神的威胁，还要在战斗中探寻世界的真相。在毁灭的尽头，人类与荒神的命运将何去何从？这场关乎种族存亡的竞争，正以鲜血与信念为代价，激烈地展开着。