《云的彼端，约定的地方》讲述了战后日本被分割为南北两部分，少年藤泽浩纪和白川拓也共同暗恋同年级的泽度佐由理的故事。三位少年少女心中除了对彼此的情感，还对边境以北津轻海峡上高耸入云的“塔”充满向往。这座由日本北海道联盟建造的神秘巨塔成为他们梦想的象征，三人约定一起制造小型飞机，飞向塔去探索未知的世界。 　　然而，中学三年级时佐由理突然转学至东京，这个变故让浩纪和拓也放弃了飞机制造的计划。浩纪考入东京的高中，拓也则留在青森继续学业，两人渐行渐远，曾经的约定似乎也被时间冲淡。但命运并未就此结束，多年后，佐由理在医院陷入不明原因的沉睡，这种病症与塔的力量有着神秘的联系。与此同时，塔成为南北势力争夺的焦点，战争一触即发。 　　浩纪和拓也再次聚首，试图唤醒佐由理，却发现她的沉睡与塔的力量息息相关。三人被卷入战争与爱情的漩涡，面临艰难的抉择：是拯救佐由理，还是阻止战争拯救世界？曾经的约定在命运的牵引下重新浮现，答案或许就在云的那一端，他们年少时梦想抵达的地方。故事交织着青春、爱情与科幻元素，探讨了梦想与现实、个人与世界的复杂关系。