《三国演义动画版》以东汉末年的乱世为背景，描绘了魏、蜀、吴三国鼎立的历史画卷。故事开篇，天下大乱，群雄并起，曹操凭借“挟天子以令诸侯”的策略，逐步统一北方，占据中原；刘备三顾茅庐请出诸葛亮，并在关羽、张飞等猛将的辅佐下，通过赤壁之战击败曹操，占据益州与荆州，建立蜀汉政权；而孙权继承父兄基业，稳固江东，形成三足鼎立之势。 　　随着剧情发展，三方势力展开激烈角逐。孙权趁关羽北伐曹操之际偷袭荆州，导致关羽败走麦城，最终被杀。刘备为报弟仇，亲征东吴，却在夷陵之战中惨败，病逝于白帝城，临终托孤于诸葛亮。与此同时，曹操病逝，其子曹丕废汉自立，建立魏国，标志着三国格局正式形成。 　　诸葛亮辅佐幼主刘禅，竭力维系蜀汉政权。他南征孟获稳定后方，又六出祁山北伐曹魏，却因种种原因未能成功，最终积劳成疾，病逝五丈原。姜维继承其遗志，九伐中原亦无功而返。蜀汉因刘禅昏庸逐渐衰败，最终投降魏国。东吴末帝孙皓暴虐无道，不久亦被晋所灭。至此，三国时代终结，天下归于一统。