《数码宝贝大冒险tri. 第4章：丧失》以缅因猫兽的暴走为核心，引发了一系列连锁反应。数码世界因这场灾难被迫重启，导致所有数码宝贝的记忆被清除。尽管芽心因缅因猫兽的失控陷入深深的自责，但太一等人仍决定前往数码世界，试图修复与搭档数码宝贝之间的羁绊。重逢后，孩子们发现曾经的伙伴们已完全不记得过去，但他们依然耐心地伸出双手，试图重新建立信任。然而，比丘兽却显得格外警惕，即使退化为成长期，也拒绝接受空的关心，甚至对空优先照顾他人的行为表示不信任。空的内心因此受伤，而太一和大和面对她的失落，一时无言以对。 　　就在众人商讨下一步行动时，缅因猫兽突然出现又消失。与其他数码宝贝不同，它似乎保留了重启前的记忆，一边哭泣一边寻找着芽心。这一幕深深触动了孩子们，他们决心拯救缅因猫兽，并再次踏上数码世界的冒险之旅。然而，黑暗四天王的操纵者突然现身，阻挠了他们的计划。与此同时，现实世界中的西岛收到了姬川失踪的消息，调查中他发现姬川的行动背后隐藏着不为人知的目的，而这与他们两人过去的某件重大事件密切相关，命运的齿轮正悄然转动……