《呼喊2006》是一部充满悬疑与心理惊悚元素的电影，故事发生在东京湾岸区。当地接连发生多起离奇的杀人事件，受害者均被溺死，警方对此束手无策。警官吉冈（役所广司饰）在调查过程中，偶然在案发现场发现了一枚纽扣。然而，当他回到家时，震惊地发现自己外套上的纽扣竟少了一粒，与现场发现的完全一致。随着更多线索浮出水面，吉冈开始怀疑自己可能就是凶手，内心陷入极度的痛苦与混乱。 　　与此同时，吉冈的恋人春江（小西真奈美饰）对他的态度异常冷淡，似乎隐藏着什么秘密。为了寻找真相，吉冈重返凶案现场，却在那里听到了诡异的声音，并遇见一名神秘的红衣女子（叶月里绪奈饰）。女子声称自己15年前曾是吉冈的恋人，却被他亲手杀害。这段被遗忘的往事让吉冈更加困惑，他开始质疑自己的记忆和身份。 　　为了理清思绪，吉冈独自前往精神医生高木（小田切让饰）处寻求帮助。然而，他的老同事宫地（伊原刚志饰）也开始对他产生怀疑，在友情与职责之间陷入两难。随着调查的深入，吉冈的生活逐渐崩塌，过去的阴影与现实交织，他不得不面对一个残酷的真相——自己或许真的与这些凶杀案有关。最终，吉冈揭开了连接过去与现在的秘密，但等待他的，却是一个更加黑暗的结局。