《聆听者》的故事发生在一个没有“音乐”存在的架空世界。某天，生活在工业都市的少年某日偶遇了背着巨大乐器的神秘少女ミュウ。她对少年说出了一个惊人的事实——这个世界其实曾经充满音乐，但某种未知力量将“音乐”的概念从人们记忆中彻底抹去了。ミュウ正是为数不多仍记得音乐存在的“聆听者”之一。 　　随着两人结伴同行，他们逐渐发现这个世界隐藏着许多异常现象：某些地点会突然响起无人听见的旋律，部分人会对特定节奏产生无意识反应。更令人不安的是，一个名为“静默教团”的神秘组织正在系统性地消除所有与音乐相关的痕迹。少年开始意识到，音乐消失背后可能藏着改变世界本质的巨大秘密。 　　在追寻真相的旅途中，ミュウ用她携带的乐器演奏出震撼人心的旋律，这些音符似乎具有唤醒记忆的奇妙力量。两人不断遭遇静默教团的追捕，同时也在各地遇见其他残存的聆听者。随着调查深入，他们逐渐接近那个导致音乐消失的“大静默事件”的真相，而少年自身与这场灾难的关联也慢慢浮出水面……