《三只小猪3正义大联萌》讲述了三只小猪驾驶飞船前往“甜甜圈星球”的奇幻冒险。途中，飞船遭遇白洞喷射，意外坠落在冰冻星球，并在那里结识了神秘的人造外星人豆豆。豆豆性格单纯可爱，很快与三只小猪成为好朋友。然而，当他们决定护送豆豆回家时，邪恶博士突然出现，声称豆豆是臭名昭著的“四十大盗”之一。这一指控让三只小猪陷入困惑，他们必须揭开豆豆的真实身份。 　　随着剧情发展，三只小猪发现事情并不简单。他们一边躲避邪恶博士的追捕，一边寻找传说中的正义博士，希望他能证明豆豆的清白。旅途中，他们穿越各种奇异星球，遭遇重重危机，但也结识了更多伙伴。最终，三只小猪揭穿了邪恶博士的阴谋，发现他才是真正的宇宙威胁，而豆豆只是被他陷害的无辜者。 　　在团结与合作下，三只小猪与伙伴们成功击败邪恶博士，拯救了宇宙。豆豆也回到了自己的家园，正义得到伸张。这场冒险不仅考验了三只小猪的勇气和智慧，更让他们明白了友谊与信任的力量。影片以欢乐温馨的结局收尾，传递了正义终将战胜邪恶的积极主题。