《超能少年第二季》延续了第一季的荒诞与黑色幽默风格，五个拥有超能力的少年继续在混乱中挣扎。凯莉的读心术让她饱受他人阴暗想法的折磨，西蒙的隐形能力使他逐渐与社会脱节，科蒂斯频繁使用时光倒流却陷入更糟的循环，艾丽莎的能力引发一系列失控的欲望漩涡，而雷森在发现自己的不死之身后，开始用极端方式测试生命极限。五人因抛尸湖底的秘密终日惶惶，殊不知他们的一举一动都被神秘面具人监视。 　　新登场的超能力者将混乱推向高潮。一个能操纵记忆的女人让雷森忘记了自己的身份，科蒂斯在时间跳跃中意外创造平行时空，而最危险的当属能吸收他人超能力的"黑洞男"。当西蒙被面具人诱导着觉醒新能力——释放致命辐射时，五人组内部开始分崩离析。艾丽莎在欲望操纵中险些害死同伴，凯莉则窥见了面具人身份的关键线索：他竟是未来时空因辐射变异后的西蒙。这个黑暗预言让少年们意识到，超能力不是恩赐而是诅咒。 　　本季在癫狂表象下探讨着更深刻的人性命题。当科蒂斯试图用时间能力挽救车祸女孩却导致更多人死亡，当雷森发现永生意味着目睹所有挚爱离去，超能力者终究要面对"能力越大越不自由"的悖论。最终集里，面具人揭晓了更惊人的真相：这场改变命运的风暴并非意外，而是政府超人类实验的产物。五人组在废弃军事基地找到的录像带显示，还有更多超能力者散落世界各地，而他们的故事，才刚刚开始。