《命运航班 Manifest》第三季继续探索蒙特哥航空828号航班的神秘事件。飞机在消失五年后突然重现，乘客们却感觉只过了几个小时。随着他们逐渐适应这个“新常态”，更多超自然现象和未解之谜浮出水面。Michaela Stone在回归后决心重新审视自己的人生，她与警探Jared Williams的感情纠葛也变得更加复杂。Jared虽然已经放下过去，但Michaela的回归让他陷入情感漩涡，两人不得不面对时间带来的隔阂与变化。 　　Ben Stone仍在努力破解脑海中神秘声音的谜团，同时为儿子Cal的罕见癌症寻找治愈方法。他与妻子Grace的关系因五年分离而经受考验，但两人都决心重建家庭。Grace在丈夫和儿子奇迹般回归后，努力适应这个“失而复得”的家庭，而Olive则要面对与双胞胎哥哥Cal之间的年龄差异，这让她感到孤独与困惑。 　　与此同时，医学研究员Saanvi发现她的工作在这五年间取得了重大突破，但她很快意识到，这些突破可能与828航班的超自然现象有关。随着政府机构对乘客们的监视越来越严密，他们必须团结起来，揭开航班背后的真相。第三季中，乘客们逐渐发现，他们的回归并非偶然，而是某种更大命运的一部分。随着新的“召唤”出现，他们被迫面对更危险的挑战，而真相或许比他们想象的更加惊人。