《末日巡逻队》第三季延续了这支另类超级英雄团队的荒诞冒险。这一季中，队员们继续在首席的领导下应对各种超自然威胁，同时也在努力解决各自的内心创伤和身份认同问题。克里夫仍在适应自己的机器人身体，丽塔尝试控制自己的变形能力，拉瑞与负能量体共存，而疯女简则在处理多重人格的困扰。他们的生活因一位神秘新角色红夫人的出现而变得更加复杂。 　　红夫人是一位来自未来的时空旅行者，她穿越到现代与末日巡逻队相遇，带来了关于未来的警告。她的到来引发了一系列时空混乱，导致现实出现裂缝，过去和未来的事件开始交织。红夫人声称末日巡逻队在未来犯下了可怕的错误，必须现在纠正，否则将导致灾难性后果。然而，她的真实动机和身份始终笼罩在谜团中，队员们不确定是否应该信任她。 　　随着剧情推进，红夫人与团队的关系逐渐深化，她似乎对某些成员有着特殊的联系，尤其是疯女简。她的出现迫使队员们直面自己的过去和未来，甚至揭示了一些被遗忘的记忆。与此同时，反派“兄弟会”也在暗中行动，试图利用时空混乱达成自己的目的。末日巡逻队必须在红夫人的引导下修复时间线，同时防止世界陷入更大的危机。