《少年间谍》第一季改编自安东尼·霍洛维茨的同名小说，讲述了14岁少年亚历克斯·莱德意外卷入间谍世界的冒险故事。亚历克斯从小由叔叔伊恩·莱德抚养长大，过着普通青少年的生活，直到伊恩在一场可疑的"车祸"中丧生。在调查叔叔死亡真相的过程中，亚历克斯震惊地发现父亲和叔叔都是英国军情六处的特工，而自己从小接受的各项训练正是为间谍生涯做准备。   军情六处副处长艾伦·布朗特和行动主管汤姆·哈里斯找上亚历克斯，强迫他接替叔叔未完成的任务。亚历克斯被派往康沃尔郡的寄宿学校"波普山学院"卧底，调查亿万富翁达瑞斯·塞勒和他的教育科技公司"塞勒学院"的可疑活动。在这里，亚历克斯结识了同为学生的汤姆·哈里斯和凯拉·瓦西列夫斯卡娅，三人逐渐发现塞勒正在利用学生进行一项名为"末日之锤"的神经控制武器实验。   随着调查深入，亚历克斯经历了多次生死考验：从躲避塞勒手下的追杀，到破解复杂的安保系统，再到最终挫败塞勒企图用神经武器控制英国精英阶层的阴谋。季终时，亚历克斯虽然成功完成任务，但也意识到自己已无法回归正常生活，军情六处对他的控制才刚刚开始，为后续故事埋下伏笔。