《闪电侠第二季》延续了第一季的剧情，讲述了艾伦·巴里在获得超能力后，继续以“闪电侠”的身份保护中心城的故事。第二季的开篇，艾伦与伙伴们成功击败了逆闪电，但这场胜利带来了新的危机。粒子加速器爆炸产生的时空裂缝引发了“多元宇宙”的概念，来自平行地球的极速者“Zoom”成为新的威胁。Zoom拥有远超艾伦的速度，并企图吞噬所有平行宇宙的能量，统治整个多元宇宙。 　　为了对抗Zoom，艾伦在星辰实验室团队的帮助下，开始探索平行宇宙的秘密。他遇到了来自地球2的哈里森·威尔斯，这位科学家与地球1的逆闪电截然不同，他愿意帮助艾伦提升速度。与此同时，艾伦的父亲亨利·艾伦终于洗脱冤屈，但好景不长，Zoom为了打击艾伦，残忍地杀害了亨利。这一事件让艾伦陷入巨大的悲痛，但也坚定了他击败Zoom的决心。 　　在第二季的后半段，艾伦与团队制定了最终计划，通过制造“速度力场”陷阱来困住Zoom。经过激烈的战斗，艾伦成功击败了Zoom，并将其关进了星际实验室的特殊监狱。然而，胜利的代价是沉重的，艾伦失去了父亲，同时也意识到未来还有更多未知的威胁。第二季的结尾，艾伦站在父亲的墓碑前，决心继续以闪电侠的身份守护城市，并揭开更多关于神速力的秘密。