《神盾局特工》第一季的故事始于纽约之战后，世界因外星人入侵而彻底改变。超能力者和外星科技不再是传说，神盾局作为维护全球安全的秘密组织，面临着前所未有的挑战。此时，原本在纽约之战中牺牲的特工菲尔·科尔森神秘“复活”，并被委以重任，组建一支精锐小队，应对日益复杂的威胁。 　　科尔森招募了性格各异的成员：冷酷高效的格兰特·沃德、身手不凡的梅琳达·梅、天才工程师莱奥·菲兹和生物化学专家盖玛·西蒙斯，以及擅长黑客技术的民间组织成员斯凯。这支小队不仅要调查超自然事件，还要面对内部和外部的重重阴谋。随着任务的推进，他们发现科尔森的“复活”背后隐藏着不可告人的秘密，而神盾局内部也暗流涌动。 　　本季剧情围绕小队成员的个人成长和团队磨合展开，同时穿插着对“0-8-4”（来历不明的神秘物品）的调查、超能力者的出现以及反派组织的崛起。随着剧情的深入，斯凯的真实身份逐渐浮出水面，而神盾局的信任危机也愈演愈烈，为后续的剧情埋下伏笔。本季在科幻冒险的主线下，融入了悬疑、动作和情感元素，为观众呈现了一场紧张刺激的谍战大戏。