《蓝猫淘气3000问之恐龙时代》的故事始于地球遭遇不明生物袭击，科学家发现这些生物竟是外星人利用恐龙基因改造的残暴复合体，企图侵占地球。为破解危机，蓝猫、淘气等伙伴奉命穿越时空，前往远古恐龙时代寻找原始恐龙基因样本，以研制对抗武器。 　　初到恐龙时代，团队救下一只受伤的鸭嘴龙，由此被引入庞大的恐龙族群。鸭嘴龙将蓝猫一行视为英雄，带领他们融入植食性恐龙群体。在暴风雨之夜，众人结识了温顺的副栉龙家族，却也不得不面对凶猛的霸王龙。这只孤独的掠食者因暴戾性格被同类排斥，屡次袭击弱小恐龙。蓝猫多次挺身保护幼龙，与霸王龙形成对峙。 　　转机出现在一场毁灭性泥石流中。霸王龙遇险被困，蓝猫不顾前嫌冒险施救。濒死的霸王龙被这份善意触动，袒露自己作为流浪儿的悲惨过往——自幼遭族群驱逐，只能用暴力掩饰孤独。蓝猫的包容让他第一次感受到温暖，最终放下敌意。此后，霸王龙主动加入调查队，凭借对地形的熟悉引导团队深入未知区域。然而新的威胁接踵而至：他们在探索中遭遇更凶残的暴龙，惊险的冒险再度展开……