《毒战生死线2》讲述了边境缉毒警齐思宇孤身深入虎穴的故事。上级下达秘密任务后，齐思宇化装潜入边陲小镇，调查新型毒品"蓝色妖姬"的产销链条。为接近核心毒贩，他故意在街头斗殴中展现过人武力，成功引起当地毒枭轩哥的注意。经过多重考验，齐思宇逐渐取得轩哥信任，得以参与团伙核心事务。 　　此时轩哥正与境外毒贩密谋大宗交易，但团伙二把手乌鸦始终怀疑齐思宇的身份。乌鸦多次设下致命陷阱，从酒局下毒到枪战嫁祸，都被齐思宇凭借机敏与身手化险为夷。在双方准备交易的关键时刻，乌鸦突然发难，联合境外势力发动叛变，企图除掉轩哥独占毒品市场。火拼中轩哥身受重伤，临终前将犯罪证据交给齐思宇。 　　齐思宇抓住时机向警方发出定位信号，同时利用毒贩内讧制造混乱。当两派毒枭在废弃码头激烈交火时，缉毒特警从天而降形成包围圈。最终警方不仅将跨境贩毒集团一网打尽，更在现场引爆了整批新型毒品。硝烟散尽后，齐思宇望着被朝阳染红的海面，默默擦去警徽上的血迹，继续隐入人群等待下一个任务。