《攻壳机动队：崛起4》的故事始于圣诞夜的卡森共和国，水企业与哈里曼达拉公司正在签订合作协议的大厦门外爆发了大规模民众抗议。示威者高呼口号反对企业垄断，现场气氛紧张而混乱。然而局势突然急转直下，担任现场护卫的警察机动部队毫无预兆地调转枪口，对示威群众展开血腥屠杀。这场惨剧背后，一个名为"火种"的神秘病毒程序成为关键线索，暗示着更深层的阴谋正在发酵。 　　在追查事件真相的过程中，公安9课的草薙素子与独立机动部队成员遭遇不明敌人的伏击。激战中他们救下了全身义体化的少女津田艾玛，却发现她体内植入了用于恐怖活动的虚拟记忆程序。更令人震惊的是，艾玛的意识中似乎存在着双重人格。当陆军情报部穗积上校要求接管艾玛时，9课课长荒卷大辅敏锐察觉到军方不可告人的企图，果断命令草薙将艾玛护送至中立机构501机关进行调查。 　　随着调查深入，草薙在艾玛破碎的记忆中拼凑出骇人真相：军方与企业正在合作开展某项违背人道的实验，而"火种"病毒正是他们用来清除证据的工具。艾玛作为实验体，其双重灵魂暗示着意识移植技术的重大突破与伦理危机。当草薙试图揭开被官方刻意掩盖的黑幕时，她不仅要面对来自军方和企业的围剿，更必须直面义体化时代人类灵魂归属的终极命题。影片通过这场记忆与现实的博弈，为攻壳机动队的世界观奠定了前传性质的关键伏笔。