《倭寇的踪迹》以明朝万历年间为背景，讲述了一段因武林正统之争而引发的江湖风波。故事始于天下太平之际，早年肆虐沿海的倭寇已被戚继光与俞大猷两位名将平定，武林则由四大家族共同掌控，任何新门派成立必须获得四大门派的认可。然而，平静的江湖突然被两名手持倭刀的神秘人打破，他们以凌厉刀法接连挑战四大门派，引发轩然大波。 　　这两名神秘人实为戚家军旧部，其使用的倭刀技法源自戚继光当年对抗倭寇时改良的刀法。戚继光曾借鉴倭刀持法，创出克制倭寇的独特武学，但随着他的离世与天下安定，这套刀法逐渐失传，更被中原武林视为异端邪术。二人此番现身，正是为了替戚家倭刀正名，证明其并非邪道，而是保家卫国的正统武学。然而四大门派为维护自身权威，非但不予承认，反而将他们诬为倭寇余孽，发动全武林围剿。 　　局势愈演愈烈，连隐居多年的霜叶城第一高手裘冬月（于承惠 饰）也被惊动，被迫下山参与追捕。裘冬月武功盖世，却因厌倦江湖纷争而退隐山林，此次重出江湖，内心充满矛盾。随着剧情发展，真假倭寇之辨、武林正统之争与个人信念的冲突交织在一起，一场关于武学本质与权力博弈的较量就此展开。影片通过这场风波，深刻探讨了传统与变革、权威与真理的复杂关系，展现了江湖背后的权谋与人性。