《花旗少林》讲述了一位美籍华人张正（周润发饰）受命前往中国大陆护送一件神秘宝物回美国的故事。张正来到著名的少林寺等待交接，期间与寺中一位七岁的小和尚清淳结下了纯真的友谊。然而，身为凡人的张正与出家人的生活习惯和文化差异产生了诸多冲突，许多事情让他感到意外甚至不满，这些矛盾为故事增添了轻松幽默的色彩。 　　随着剧情发展，张正惊讶地发现，所谓的宝物竟是一位拥有特异功能的少女小菁（吴倩莲饰）。小菁天真烂漫，却因自身能力而成为各方势力争夺的目标。在相处过程中，张正与小菁逐渐产生了微妙的情感，而两人也意外卷入了一场巨大的阴谋之中。面对危机，他们必须携手合作，才能化险为夷。 　　影片融合了动作、喜剧和浪漫元素，既有精彩的武打场面，又有温馨感人的情感互动。张正从最初的任务执行者，逐渐转变为保护小菁的守护者，而小菁的出现也让他重新审视自己的人生。最终，两人在少林寺的背景下，共同对抗邪恶势力，谱写了一段跨越文化与身份的动人故事。