《蝙蝠侠大战超人：正义黎明》的故事发生在大都会之战18个月后。那场战斗中，超人（亨利·卡维尔 饰）与佐德将军的激战对城市造成了巨大破坏，许多无辜市民和建筑惨遭波及。尽管超人帮助人类解决了许多危机，但他强大的力量也引发了争议。一部分人将他视为神明膜拜，而另一部分人则对他的存在感到恐惧和不安。超人因此被政府传唤审讯，他的行为是否应该受到约束成为社会热议的焦点。 　　与此同时，一度隐匿于阴影中的蝙蝠侠布鲁斯·韦恩（本·阿弗莱克 饰）重新出现在公众视野。他亲眼目睹了大都会之战的惨状，对超人不受控制的力量深感忧虑，认为这位外星英雄可能对人类构成威胁。韦恩决定采取行动，利用自己的智慧和科技装备，准备与超人展开一场对决。两人的矛盾逐渐升级，蝙蝠侠似乎铁了心要惩罚这位“危险的”超级英雄。 　　年轻的亿万富翁莱克斯·卢瑟（杰西·艾森伯格 饰）在暗中推波助澜。他利用媒体和舆论煽动公众对超人的不信任，并秘密研究氪星科技，试图制造能够对抗超人的武器。卢瑟的阴谋不仅加剧了蝙蝠侠与超人的对立，还牵扯出更深的危机。与此同时，神秘的戴安娜·普林斯（盖尔·加朵 饰）也悄然现身，她似乎对这场冲突有着自己的目的，并在关键时刻介入其中。 　　随着剧情发展，蝙蝠侠与超人的冲突达到顶点，两人展开了一场震撼人心的对决。然而，当更大的威胁——远古怪物“毁灭日”被卢瑟释放后，他们意识到必须放下分歧，联手对抗这一共同的敌人。在戴安娜的协助下，三位英雄首次集结，为保护世界而战。影片最终揭示了正义联盟的雏形，同时也为未来的故事埋下了伏笔。